《名偵探柯南：懸疑劇院之謎》游戲的主角依然是柯南+小蘭+小哀等人的標配，他們一行人來到某主題公園游玩，卻不慎被困在了一個新落成的游樂設施之中。這一次沒有案件也沒有尋寶，只要開動腦筋找到辦法逃出去!

游戲劇情

在某個主題公園之中，有個新開放的以解謎為中心的游樂設施「懸疑劇院」。阿笠博士通過抽獎得到了這一設施的體驗會門票，便在活動當天帶上了柯南、小蘭與灰原哀前往游玩。

進去之后，懸疑劇院里除了他們似乎并沒有別人……可是，不知位于何處的某個設施卻突然啟動，將4人困在其中。逃出這個地方的辦法，只有找出那些散落在館內各處的道具，解開它們上面藏著的謎題。

最終，這4個倒霉的家伙能不能平安無事地成功逃出懸疑劇院？答案毫無懸念絕對是Yes！

在通過游戲的序章、成功挑戰所有4道關卡，并且完成尾聲部分之后，才算真正的成功逃脫，最終玩家將可以看到四個倒霉鬼與鈴木園子以及少年偵探團勝利會師的情景。